——高效、高純度基因組DNA提取的標(biāo)準(zhǔn)化解決方案
一、產(chǎn)品原理與核心優(yōu)勢(shì)
1.1 技術(shù)原理
硅膠膜離心柱技術(shù):
選擇性結(jié)合DNA(>100 bp),高效去除蛋白質(zhì)、RNA及小分子污染物
基于pH調(diào)控的吸附/洗脫機(jī)制(裂解液pH=8.0,洗脫液pH=8.5)
關(guān)鍵步驟:
細(xì)胞裂解(蛋白酶K+Buffer ATL)
核酸吸附(Buffer AL+乙醇)
雜質(zhì)去除(Buffer AW1/AW2洗滌)
DNA洗脫(Buffer AE或水)
1.2 性能參數(shù)
指標(biāo) Qiagen 51304 傳統(tǒng)酚-氯仿法
得率(哺乳動(dòng)物細(xì)胞) 5-10 μg/10? cells 3-8 μg/10? cells
A260/A280 1.7-1.9 1.6-1.8(常含酚殘留)
操作時(shí)間 20-30分鐘 2-3小時(shí)
最大樣本量 5×10? cells或25 mg組織 需分多次處理
1.3 適用樣本類型
推薦樣本:
? 培養(yǎng)細(xì)胞(貼壁/懸浮)
? 動(dòng)物組織(肝、脾等軟組織優(yōu)先)
? 血液(需配合紅細(xì)胞裂解步驟)
不推薦樣本:
? 植物組織(需專用試劑盒)
? 石蠟包埋樣本(需脫蠟預(yù)處理)
二、標(biāo)準(zhǔn)化操作流程
2.1 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
試劑預(yù)冷:Buffer AW1/AW2需4℃保存,使用前室溫平衡
樣本預(yù)處理:
復(fù)制
貼壁細(xì)胞:胰酶消化后PBS重懸
組織樣本:液氮研磨至粉末狀
2.2 詳細(xì)操作步驟
復(fù)制
1. 裂解:
- 加20 μL蛋白酶K + 200 μL Buffer ATL
- 56℃孵育10分鐘(組織需延長至30分鐘)
2. 結(jié)合:
- 加200 μL Buffer AL + 200 μL乙醇(96-100%)
- 渦旋混勻15秒
3. 過柱:
- 轉(zhuǎn)移混合液至離心柱,≥6000 g離心1分鐘
4. 洗滌:
- 加500 μL Buffer AW1,離心1分鐘
- 加500 μL Buffer AW2,離心3分鐘(確保去鹽)
5. 洗脫:
- 加50-100 μL Buffer AE,室溫靜置5分鐘后離心
2.3 關(guān)鍵優(yōu)化點(diǎn)
提高得率:
延長組織裂解時(shí)間至2小時(shí)
二次洗脫(使用同一洗脫液)
提高純度:
增加AW2洗滌離心至5分鐘
洗脫前空離2分鐘去除殘留乙醇
三、質(zhì)量評(píng)估與問題排查
3.1 質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)
純度合格:A260/A280=1.7-1.9,A260/A230>2.0
完整性驗(yàn)證:
? 0.8%瓊脂糖凝膠電泳,主帶>10 kb(無拖尾)
? 適用于PCR、Southern blot等下游應(yīng)用
3.2 常見問題診斷
現(xiàn)象 可能原因 解決方案
得率低 /乙醇比例錯(cuò)誤 增加蛋白酶K用量/檢查乙醇濃度
A260/A280異常 蛋白質(zhì)或酚殘留 增加AW2洗滌步驟
DNA降解 樣本反復(fù)凍融/RNase污染 使用新鮮樣本/添加RNase抑制劑
3.3 應(yīng)用案例數(shù)據(jù)
案例1:小鼠尾尖基因分型
結(jié)果對(duì)比:
復(fù)制
Qiagen 51304:平均得率8.2 μg,PCR成功率98%
CTAB法:平均得率5.1 μg,PCR成功率85%
案例2:FFPE樣本提取
優(yōu)化方案:
增加蛋白酶K至40 μL,裂解過夜
得率提升3倍(從0.5 μg至1.5 μg/10 μm切片)
四、技術(shù)問答(Q&A)
Q1:能否用于微量樣本(<10? cells)?
需配合 載體RNA(如Qiagen 1017456) 提高回收率(建議終濃度5 ng/μL)
Q2:洗脫緩沖液選擇建議?
Buffer AE:含EDTA,適合長期儲(chǔ)存(-20℃)
無菌水:適用于立即使用的PCR等應(yīng)用
文檔優(yōu)化建議:
插入 【電泳檢測(cè)示例圖】 標(biāo)注完整性與降解DNA區(qū)別
添加 得率計(jì)算工具 二維碼(鏈接至在線計(jì)算器)
關(guān)鍵步驟用 ??注意 標(biāo)注(如"勿讓離心柱干燥")